Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc61Q3UJV1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc61Q3UJV1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms