Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b2Q3UJB0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms