Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dtx3lQ3UIR3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dtx3lQ3UIR3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms