Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc6cQ3UHC0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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