Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc177Q3UHB8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms