Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rrp36Q3UFY0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms