Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Puf60Q3UEB3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Puf60Q3UEB3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms