Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Yipf3Q3UDR8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Yipf3Q3UDR8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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