Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brf2Q3UAW9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brf2Q3UAW9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms