Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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Gtpbp6Q3U6U5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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Gtpbp6Q3U6U5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Gtpbp6Q3U6U5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Gtpbp6Q3U6U5 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Gtpbp6Q3U6U5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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Gtpbp6Q3U6U5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Gtpbp6Q3U6U5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Gtpbp6Q3U6U5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Gtpbp6Q3U6U5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gtpbp6Q3U6U5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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