Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3U6N9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U6N9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms