Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf40Q3U319 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Rnf40Q3U319 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf40Q3U319 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf40Q3U319 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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