Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf149Q3U2C5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms