Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Serac1Q3U213 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Serac1Q3U213 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms