Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Q3U1D9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q3U1D9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q3U1D9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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