Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Palb2Q3U0P1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Palb2Q3U0P1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 433.3 ms