Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ankrd33bQ3U0L2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ankrd33bQ3U0L2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms