Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hace1Q3U0D9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hace1Q3U0D9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms