Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms