Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrc28Q3TX51 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc28Q3TX51 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms