Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fbxw18Q3TSA9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms