Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fndc4Q3TR08 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fndc4Q3TR08 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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