Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CiartQ3TQ03 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms