Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
XylbQ3TNA1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XylbQ3TNA1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms