Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc102aQ3TMW1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms