Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpgp1Q3TLS3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms