Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc10Q3TLI0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc10Q3TLI0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms