Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc13Q3TIR1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms