Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jmjd8Q3TA59 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jmjd8Q3TA59 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms