Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml4Q3LRV9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Treml4Q3LRV9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms