Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpm1Q2TV84 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm1Q2TV84 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms