Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pi4k2aQ2TBE6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pi4k2aQ2TBE6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms