Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vax1Q2NKI2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vax1Q2NKI2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms