Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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Shroom4Q1W617 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Shroom4Q1W617 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Shroom4Q1W617 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Shroom4Q1W617 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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Shroom4Q1W617 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom4Q1W617 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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Shroom4Q1W617 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom4Q1W617 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom4Q1W617 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom4Q1W617 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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