Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cpne9Q1RLL3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpne9Q1RLL3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpne9Q1RLL3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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