Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms