Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim71Q1PSW8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim71Q1PSW8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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