Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sap25Q1EHW4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms