Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptcd3Q14C51 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptcd3Q14C51 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms