Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd3Q14AI6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms