Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rpusd2Q149F1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Rpusd2Q149F1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Rpusd2Q149F1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Rpusd2Q149F1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Rpusd2Q149F1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Rpusd2Q149F1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Rpusd2Q149F1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd2Q149F1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms