Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc162pQ0VG85 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc162pQ0VG85 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms