Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itgb8Q0VBD0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms