Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cntnap5cQ0V8T7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cntnap5cQ0V8T7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cntnap5cQ0V8T7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Cntnap5cQ0V8T7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5cQ0V8T7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5cQ0V8T7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5cQ0V8T7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5cQ0V8T7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cntnap5cQ0V8T7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms