Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lrriq1Q0P5X1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Lrriq1Q0P5X1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms