Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps8Q0P5W1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms