Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TrioQ0KL02 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrioQ0KL02 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms