Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kndc1Q0KK55 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Kndc1Q0KK55 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms