Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc21bQ0HA38 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms