Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf541Q0GGX2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf541Q0GGX2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms