Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cass4Q08EC4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms